Od početka pandemije, dijagnostičko testiranje ima ključnu ulogu u kontroli širenja SARS-CoV-2, virusa koji uzrokujeCOVID 19.Brzi testovi na antigenkoje se izvode kod kuće ili u kliničkom okruženju daju rezultate za 15 minuta ili manje.Što se prije dijagnosticira osoba, to prije može potražiti medicinsku pomoć i izolirati se od drugih.Ali kada se pojave nove varijante virusa, te varijante možda neće biti otkrivene ovim testovima.
Većina brzih antigenskih testova dizajnirana je za otkrivanje SARS-CoV-2 nukleokapsidnog proteina ili N-proteina.Ovaj protein se nalazi u izobilju u virusnim česticama i zaraženim ljudima.Komplet za brzi tests obično sadrže dva različita dijagnostička antitijela koja se vezuju za različite dijelove N proteina.Kada se antitijelo veže za N protein u uzorku, na testnom kompletu se pojavljuje obojena linija ili drugi signal, što ukazuje na infekciju.
Protein N se sastoji od 419 strukturnih jedinica aminokiselina.Bilo koja od njih može se mutacijom zamijeniti drugom aminokiselinom.Istraživačka grupa koju vodi dr.sc.Philip Frank i Eric Ortlund sa Univerziteta Emory krenuli su da istraže kako ova promjena jedne aminokiseline utiče na performanse brzog testa na antigen.Koristili su tehniku ​​zvanu skeniranje dubokih mutacija kako bi istovremeno procijenili kako svaka mutacija u N proteinu virusa utječe na vezivanje za dijagnostičko antitijelo.Njihovi rezultati objavljeni su u Cellu 15. septembra 2022.
Istraživači su stvorili opsežnu biblioteku od skoro 8.000 mutacija N proteina.Ove varijante čine više od 99,5% svih mogućih mutacija.Zatim su procijenili kako svaka varijanta stupa u interakciju sa 17 različitih dijagnostičkih antitijela korištenih u 11 komercijalno dostupnih brzih testova na antigen, uključujući uobičajenekućni kompleti.
Tim je procijenio koje mutacije N-proteina utiču na prepoznavanje antitijela.Na osnovu ovih informacija, kreirali su "profil mutacije u bijegu" za svako dijagnostičko antitijelo.Ovaj profil identifikuje specifične mutacije u N proteinu koje mogu uticati na sposobnost antitela da se veže za svoju metu.Analiza je pokazala da antitijela koja se koriste u današnjim brzim testovima prepoznaju i vezuju sve prethodne i sadašnje varijante SARS-CoV-2 koje izazivaju zabrinutost i zabrinutost.
Iako nekoliko dijagnostičkih antitijela prepoznaje istu regiju N proteina, istraživači su otkrili da svako antitijelo ima jedinstveni potpis mutacije koja može izbjeći.Kako virus SARS-CoV-2 nastavlja da mutira i stvara nove varijante, ovi podaci se mogu koristiti za označavanje antitijela u kompletu za testiranje koja će možda trebati ponovo procijeniti.
"Precizna i efikasna identifikacija zaraženih osoba ostaje kritična strategija za ublažavanje posljedica COVID-19, a naša studija pruža informacije o budućim mutacijama SARS-CoV-2 koje bi mogle ometati otkrivanje", rekao je Ortlund.“Rezultati koji su ovdje navedeni omogućavaju nam da se brzo prilagodimo ovom virusu kako se nove varijante nastavljaju pojavljivati, što predstavlja neposredne kliničke i javnozdravstvene implikacije.”
Pozadina: Duboko skeniranje mutacije otkriva escape mutacije u nukleokapsidu SARS-CoV-2 koristeći trenutno dostupne brze testove na antigen.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA ćelija.2022. 15. septembar;185(19):3603-3616.e13.Ministarstvo unutrašnjih poslova: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29. avgusta 2022. PMID: 36084631.
Finansiranje: Nacionalni institut za biomedicinsko snimanje i bioinženjering NIH (NIBIB), Nacionalni institut za dijabetes, probavne i bubrežne bolesti (NIDDK) i Nacionalni institut za alergije i infektivne bolesti (NIAID), Američko udruženje za srce.
NIH Research Matters je sedmično ažuriranje ključnih nalaza istraživanja NIH-a koje su pregledali stručnjaci NIH-a.Objavljuje ga Ured za komunikacije i odnose s javnošću direktora Nacionalnog instituta za zdravlje.